Starec Paisij sa narodil 25. júla 1924 v Kappadockej Fárase. Jeho otec sa volal Pródromos a matka Eulogía.
V roku 1924 sa uskutočnila výmena obyvateľstva a kresťanov Malej Ázie vykorenili z ich rodného domova. Paisijova rodina spolu s ďalšími Fárasiotčanmi odišla do trpkého vyhnanstva.
Prvýkrát prišiel na Svätú Horu Atos v roku 1949. Na žiadosť svojho otca sa však vrátil domov, aby pomohol rodine. Keď dal do poriadku všetky rodinné záležitosti, v roku 1950 opäť odišiel na Atos.
V roku 1954 bol podstrihnutý na mnícha a prijal meno Avérkios. Keď sa modlil, jeho myseľ bola uchvacovaná do duchovného nazerania a pociťoval pozvanie púšte. Dostal požehnanie odísť z monastiera, aby mohol žiť pustovníckym životom.
V roku 1957 bol podstrihnutý na mnícha s malou schimou a dostal meno Paisij. V roku 1958 odišiel zo Svätej Hory Atos do monastiera Stomio a začal s jeho obnovou.
V roku 1962 odišiel na Svätú Horu Sinaj a usadil sa v pustovni svätých Galaktíona a Epistímy. Do monastiera svätej Kataríny schádzal každú nedeľu alebo každých pätnásť dní a pristupoval k svätému Prijímaniu.
Zo zdravotných dôvodov odišiel zo Sinaja a vrátil sa na Atos. V roku 1966 prijal Veľkú a anjelskú schimu. Jeho choroba sa zhoršovala a bol nútený podstúpiť operáciu. Zobrali mu takmer celú ľavú časť pľúc a tiež dve rebrá. Keď sa z nemocnice vrátil do skýtu, pokračoval vo svojom asketickom zápase.
Starec Paisij Svätohorský pokojne zosnul 12. júla 1994. Pochovali ho za chrámom ctihodného Arsénia Kapadockého v isychastíriu svätého Jána Teológa v Suroti neďaleko Tessaloník.